功能性胃腸功能紊亂是反覆復發與好轉的慢性疾病，但不是危及生命或留下結構損傷的疾病。研究表明，持續維持治療和生活管理的患者中，相當一部分在數月內症狀大幅減輕，部分人長期保持無症狀狀態。壓力管理、飲食調節和適當治療三者兼備時，預後最佳。

韓醫診所觀點

韓醫治療不僅止於緩解症狀，而是側重於改變易復發的體質基礎。即使短期症狀緩解後，充分夾實胃腸基礎體力，可以延長復發間隔、減弱復發強度。